För
tio år sedan var forskarvärlden hoppfull. Det första utkastet av
det mänskliga genomets
sekvens utropades som gryningen för en ny era inom genetisk medicin.
Nu skulle det gå att skräddarsy mediciner efter en patients
genetiska profil. Francis Collins, ledare för IHGSC konsortiet för
kartläggningen
av genomet,
gissade kunde bli verklighet år 2010. Ärligt
talat har den medicinska betydelsen av genomprojektet varit mycket
liten hittills. Vad gick fel?
Det
finns få saker som åldras så dåligt som förutsägelser.
Kortsiktiga förutsägelser baserade på prototyper i laboratorier
eller under testning har problemet att de sällan förutsäger i
vilken ordning teknikerna kommer i allmänt bruk. Orsaken är att
även om de med god säkerhet identifierar vad som är på väg så
är den kontext av ekonomi, politiska beslut och kunders val som
avgör hur snabbt de utvecklas för komplex för att förutsägas med
säkerhet. Även en tekniskt lyckad uppfinning kan behöva övervinna
mycket motstånd och förseningar innan den når ut. Den kan också
få nya användingsområden som ingen väntat sig.
Kartläggningen
av genomet liknar månlandningen, en triumf för teknisk förmåga
snarare än vetenskaplig förståelse. Det
är svårt att gå från kunskap om att en sjukdom är genetiskt
betingad, även om det bara rör sig om en gen som för cystisk
fibros,
till att skapa ett läkemedel. Oftast rör sig sjukdomar om ett
komplicerat samspel mellan olika gener.
Tveklöst
kommer kunskapen om sekvensen på våra tre miljarder byggstenar i
vårt DNA hjälpa utvecklingen av nya mediciner. Om inte annat tog
genomprojektet stormsteg för sekvensieringstekniken, vilket sänkte
kostnader och ökade hastigheten på forskningen.
Kapplöpningen
mellan det statligt finansierade IHGSC och företaget Celera, ägt av
Craig Venter, påminde inte så lite om rymdkapplöpningen mellan USA
och Sovjetunionen med liknande resultat.
Vetenskap
handlar ofta om att formulera rätt frågor, där ligger stötestenen.
När frågorna sedan är rätt brukar insamlingen och analysen av
data vara mindre svårt. Forskarna
såg frågan om hur generna ligger placerade på DNA-strängen som det viktiga, utan att riktigt förstå vad
genomet faktiskt gör. Det fanns inte några väldefinierade frågor
som projektet skulle besvara. Kunskap och möjliga tillämpningar
skulle trilla fram ur de data som togs fram, ungefär som
rymdstationer och tillämpningar skulle trilla fram av att Neil
Armstrong gått på månen.
Den synen har funnits sedan nobelpristagarna Francis Crick och
James Watson löste problemet med DNA- molekylens struktur 1953. Det
ledde till en syn på genomet som en ritning, vilket lätt ledde till en
genetisk determinism. Vi bestäms av vilka gener vi har. Här
protesterar nog många genetiker, det har vi ju alltid sett som en
förenkling, men visst har förenklingen varit lockande.
Synen
var att genomet bestod av gener som bestämmer hur proteinerna i
cellernas biokemi plockades ihop. Generna låg inbäddade i en massa
skräp-DNA, gamla eftersläntrande gener som evolutionen i sitt slarv inte plockat bort. Genom RNA översattes generna direkt
till proteiner.
Problemet är att en viss gen inte behöver ha en unik koppling till
ett visst protein. Mycket skräp-DNA spelar troligen en okänd roll i
vår biologi med att reglera generna. Vad generna gör är inte
alltid uttryckt i genomet, som hur kromosomerna packas och genetiska
markörer fungerar.
Genforskningen
står nog inför ett paradigmskifte, att ändra sin syn på vad i
ämnet som är viktigt och hur forskningen skall gå till. Vårt
genom är inte en kod att knäcka, utan kanske mer likt komplexa
system av återkopplingar och ömsesidiga beroenden som klimatet. Det
är ett viktigt skifte i vetenskapen, från insamlandet och
masserandet av data till att börja formulera frågor och bygga
system som går att testa. Det är ett mer spännande och
fantasifullt arbete som väntar forskarna.
Waldemar Ingdahl den 27 juni 2010 10:16